После провозглашения в августе 1991 года Республики Молдова началось формирование национальных ВВС. По наследству от СССР Молдове достались 7 МиГ-29 изделие «9-12», 24 изделия «9-13» из состава бывшего 86-го иап Черноморского флота, дислоцировавшегося на аэродроме Маркулешты, и 4 спарки. Но летать на них было не кому, поскольку все разъехались по разным уголкам бывшего СССР. Правительство Молдовы предприняло определенные усилия для привлечения пилотов в свои ВВС, на МиГ-29 набралось лишь четыре человека и именно им пришлось участвовать в приднестровском конфликте 1992 года. МиГ-29 использовались для нанесения бомбовых ударов по наземным целям, правда, безрезультатно. Отчасти это связано с квалификацией пилотов, поскольку в мирное время основной упор при их подготовке делался на борьбу с воздушными целями, да и возможности прицельного комплекса истребителя тогда были весьма скромными. При этом молдаване потеряли один «МиГ».
Впоследствии молдаване продали один истребитель Румынии, четыре Йемену и 21, включая один МиГ-29УБ — США. Сегодня в Молдове числится лишь шесть машин, которые однажды проходили капитальный ремонт в Белоруссии. При этом самолеты получили камуфляж, принятый в белорусских ВВС.
В мае 2010 года Министерство обороны Молдавии выставило на продажу все шесть МиГ-29, однако спустя четыре месяца покупателей на них так и не нашла. Перед продажей планировалось отремонтировать самолеты, но позже Министерство обороны отказалось от этого, решив реализовать их в текущем состоянии. При этом все истребители уже тогда были непригодны для эксплуатации.
Казалось, к середине ноября участь молдавских «МиГов» была окончательно решена. Их в том же месяце должны были выставить на аукцион по общей стартовой цене 8500 тысяч долларов. Сообщалось, что если товар не удастся реализовать, то самолеты разберут на запчасти и сдадут в металлолом. Но аукцион перенесли на конец декабря. Выставленные на продажу МиГ-29 нуждаются в ремонте, который оценивается почти в 30 млн. долларов.